Bekannt für seine außergewöhnliche Sammlungen, zum Beispiel: Filipinas Heritage Libraries – eine moderne Bibliothek mit über tausend zeitgenössischen Titeln zu philippinischer Kunst, Kultur und Geschichte; Philippine Diorama Experience – 60 handgefertigte Dioramen zu den Meilensteinen der philippinischen Geschichte; Gold of Ancestors – diese Ausstellung ist das Glanzstück des Museums und zeigt eine Sammlung archäologischer Artefakte und Schätze aus der vorkolonialen Zeit.